Penso que a religião pode ser um tema como qualquer outra dado que fazer letras é uma forma de expressão de sentimentos quer sejam de revolta para com a sociedade, quer sejam de revolta para com Deus ou com o que for. Naturalmente (ou não) é mais comum ver-se abordado o primeiro tema pelas bandas de Nu Metal/hardcore e o segundo pelas de Black Metal, por exemplo. Mas não é obrigatoriamente assim. Até porque pode-se falar de religião de duas formas:

Expressar revolta, mágoa ou devoação de forma inteligente e equilibrada.
ou então...

Fazer como certas bandas de black metal fazem em que as letras não têm valor nenhum.. são apenas "Fuck Christ", "Drink the blood of the pig", "666", "Fuck God", "Fuck the Virgin Mary", bla bla bla...
Esta última para mim não vale um cu e a maior parte das vezes, para mim, é o que distingue o bom black metal do mau black metal. Uma banda de black que toque muito bem mas o seu espirito é só "Fuck Jesus, Fuck the Virgin" não vale um cu.
It's only what I think..

Ride on!